Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD7Q9P2D1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD7Q9P2D1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD7Q9P2D1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD7Q9P2D1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD7Q9P2D1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD7Q9P2D1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD7Q9P2D1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD7Q9P2D1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD7Q9P2D1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD7Q9P2D1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms