Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GAL3ST1Q99999 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms