Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM47Q96LD4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms