Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A4AQ96JQ5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms