Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD4Q7Z3J3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms