Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms