Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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RPE65Q16518 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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