Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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