Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms