Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GAPVD1Q14C86 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
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