Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms