Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF6P49848 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF6P49848 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms