Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX1P48742 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX1P48742 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX1P48742 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX1P48742 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX1P48742 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX1P48742 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX1P48742 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms