Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg3P47867 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scg3P47867 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms