Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNMT1P26358 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms