Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PPLO60437 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPLO60437 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPLO60437 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPLO60437 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPLO60437 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPLO60437 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPLO60437 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PPLO60437 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms