Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
U2SURPO15042 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2SURPO15042 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms