Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms