Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SNX13Q9Y5W8 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SNX13Q9Y5W8 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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SNX13Q9Y5W8 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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