Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms