Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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