Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms