Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms