Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CLPPQ16740 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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