Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FXNQ16595 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FXNQ16595 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FXNQ16595 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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FXNQ16595 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FXNQ16595 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FXNQ16595 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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