Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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SSX1Q16384 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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SSX1Q16384 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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SSX1Q16384 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSX1Q16384 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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