Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
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