Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SYCP1Q15431 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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SYCP1Q15431 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
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SYCP1Q15431 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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SYCP1Q15431 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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SYCP1Q15431 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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SYCP1Q15431 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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