Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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SMCO1Q147U7 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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SMCO1Q147U7 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMCO1Q147U7 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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SMCO1Q147U7 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SMCO1Q147U7 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SMCO1Q147U7 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SMCO1Q147U7 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SMCO1Q147U7 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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