Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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GBX1Q14549 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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GBX1Q14549 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GBX1Q14549 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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GBX1Q14549 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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GBX1Q14549 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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