Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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