Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RUNX3Q13761 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms