Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HTR4Q13639 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HTR4Q13639 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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