Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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CDH18Q13634 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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CDH18Q13634 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDH18Q13634 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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