Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP3B2Q13367 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms