Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
KLF1Q13351 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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