Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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PTGDRQ13258 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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PTGDRQ13258 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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PTGDRQ13258 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTGDRQ13258 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTGDRQ13258 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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