Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms