Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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