Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPA4Q13156 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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