Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NR1H3Q13133 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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