Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CSTF3Q12996 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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