Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms