Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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