Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms