Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRMP28827 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms