Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX13Q9Y5W8 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms