Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXQ1Q9C009 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXQ1Q9C009 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXQ1Q9C009 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXQ1Q9C009 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXQ1Q9C009 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXQ1Q9C009 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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FOXQ1Q9C009 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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