Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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