Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MEIS3Q99687 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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MEIS3Q99687 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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MEIS3Q99687 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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MEIS3Q99687 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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MEIS3Q99687 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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MEIS3Q99687 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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MEIS3Q99687 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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MEIS3Q99687 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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MEIS3Q99687 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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MEIS3Q99687 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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